Em julho de 2010 o Hospital Nossa Senhora Aparecida foi municipalizado, por meio do decreto nº 14051, de 27 de julho de 2010. Até então o hospital era privado e fazia atendimentos pelo SUS por meio de contratualização.
Em setembro do mesmo ano, o HNSA passou a integrar o Complexo Hospitalar Odilon Behrens, após decreto nº14128, de 23 de setembro de 2010.
Atualmente a unidade conta com 38 leitos de Clínica Médica que atendem a pacientes clínicos de longa permanência egressos do HOB. As vagas também são disponibilizadas, de acordo com o perfil dos pacientes, para a UPA HOB e a UPA Nordeste, que funciona no mesmo prédio da unidade.
Os pacientes internados no HNSA têm a retaguarda para exames e procedimentos mais complexos e interconsultas com especialistas, como neurologia e cirurgia vascular, quando necessário, do Hospital Metropolitano Odilon Behrens.
