A GESER dispõe de quatro Núcleos de Intervenção em Saúde Funcional, organizados por carreira, quer sejam, Saúde, Educação, Segurança Pública e Administração Geral e outras carreiras, sendo constituído por equipe técnica da Coordenação de Saúde Funcional e tendo como foco de atuação a saúde funcional do agente público. A metodologia dessa equipe multidisciplinar formada por referências técnicas consiste em intervir no processo de trabalho quando identificado um adoecimento físico ou mental que resulte na incapacidade laborativa parcial, que pode afetar a adaptação e o desempenho do agente público e a realização das atividades inerentes ao seu cargo. O Núcleo atua também no monitoramento durante o processo de readaptação funcional e no processo de inclusão do agente público com deficiência (PcD).